A higienização é importante para garantir o bom funcionando do ar condicionado. Pó, fungos e bactérias se acumulam no interior da peça, podendo causar não só a obstrução dos tubos da câmara de refrigeração, mas também danos à saúde dos ocupantes do carro. Para  fazer a higienização completa, é necessário trocar o filtro. O filtro de ar-condicionado tem a função de purificar o ar que vem da rua para dentro do carro, além de eliminar odores. Para a troca desse filtro não existe um prazo definido por quilometragem, pois isso depende da frequência de utilização do carro com o ar condicionado ligado.